JR貨物新・更新色である。
なお、この54号機はJR西日本から購入し、そのまま国鉄特急色（原色）で活躍していたので、JR貨物標準色は経ていない。
その後2004年末までに、16号機、20号機、19号機、31号機が相次いでこの新カラーで出場した。
原色機を彷彿させるそのカラーリングに当初はかなり注目された。
一部のファンでは「国鉄色モドキ」と呼ばれているとか？
翌2005年も、41号機、34号機、10号機、37号機、12号機、28号機・・・と続々と全検出場した際に新更新色化されていった。
この「新更新カラー」、当初は試験的に色々と個体差があり、第5弾出場の31号機まで細部で塗り分けが異なる。
以下に紹介する。
↑2004年2月19日出場、新更新色第1号の54号機。
手すりや車体の裾（すそ）帯は白色。
ライトの縁はボディ同色。
↑2004年3月8日出場、新更新色第2号の16号機では、車体裾の白帯が少し細くなった。
相変わらず一次車（20号機より若番機）にはクーラー未設置。
↑2004年3月29日出場、新更新色第3号の20号機。
裾帯が前面と同じクリーム色に変更。
手すりは前面・側面全て白色のまま。
この20号機まではライトの縁が青色。
↑2004年7月13日出場、第4弾、19号機。
側面扉の手すりがそれまでの白から本体同色に塗装。
前面の2対の手すりは白色のまま。
以降、裾帯はクリーム色で落ち着いた模様。
ライトの縁がこの19号機以降はシルバーとなった。
↑2004年11月1日出場、第5弾、31号機。
裾帯はクリーム色、乗務員扉の手すりは前回同様の青色。
変更点は、それまで白色だった前面の2対の手すりが色分けされている。
ライト内側の手すりはクリーム色、ライト下側の手すりは青色。
↑2005年1月25日出場、第6弾、41号機。
前回の31号機と同一の塗り分けとなっている。
この塗装パターンで落ち着いた模様。
↑2005年2月16日出場、第7弾、34号機。
前回の41号機と全く同様であり、31号機以降の塗り分けパターンに完全定着した。
↑2005年6月10日出場、第8弾、10号機。
塗装パターンは前回と変化はないものの、一次車は側面のメーカーズプレートが上方へ付いているため裾のラインが途切れずスッキリしている。
以下、塗り分けが完全固定されたため写真は省略するが、その後 続々と更新化がすすんだ。
2003年度更新（54、16、20号機）
2004年度更新（19、31、41、34号機）
2005年度更新（10、37、12、28、9、38、17号機）
2006年度更新（36、39、33、25、27、44、23、22号機）
2007年度更新（32、52、35、24、26、21号機）
2008年度更新（29号機）
2010年度更新（30号機）
2011年度更新（33、36号機）
